因为当你创建一个虚拟环境的时候,一些软链接创建到原来的python上。
当用Homebrew更新python后,原来软连接对应的python已经不存在了。
因此需要把软链接指向新的python。
解决方法是移除原来虚拟环境里的软连接,然后重新创建:

find ~/.virtualenvs/my-virtual-env/ -type l -delete  # 找到旧链接并删除
virtualenv ~/.virtualenvs/my-virtual-env  # 创建新链接

我的问题解决了。

此回答来自stackoverflow : stackoverflow

未经作者允许,禁止转载